Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP9O75884 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP9O75884 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP9O75884 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP9O75884 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms