Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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