Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms