RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368166.7

CD1E-211, Transcript of CD1e molecule, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD1E, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1E-211ENST00000368166 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.12■■■■■ 4.65
CD1E-211ENST00000368166 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.03■■■■□ 3.84
CD1E-211ENST00000368166 ABCC9O60706 1549 aa37.71■■■■□ 3.63
CD1E-211ENST00000368166 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
CD1E-211ENST00000368166 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.66■■■■□ 3.46
CD1E-211ENST00000368166 NACADO15069 1562 aa36.62■■■■□ 3.45
CD1E-211ENST00000368166 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.58■■■■□ 3.45
CD1E-211ENST00000368166 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.57■■■■□ 3.44
CD1E-211ENST00000368166 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.54■■■■□ 3.44
CD1E-211ENST00000368166 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.63■■■■□ 3.29
CD1E-211ENST00000368166 SCRIBQ14160 1630 aa35.58■■■■□ 3.29
CD1E-211ENST00000368166 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.36■■■■□ 3.25
CD1E-211ENST00000368166 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.24
CD1E-211ENST00000368166 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.14■■■■□ 3.22
CD1E-211ENST00000368166 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
CD1E-211ENST00000368166 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.27■■■■□ 3.08
CD1E-211ENST00000368166 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.2■■■■□ 3.07
CD1E-211ENST00000368166 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CD1E-211ENST00000368166 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.15■■■■□ 3.06
CD1E-211ENST00000368166 SMARCA4P51532 1647 aa34.12■■■■□ 3.05
CD1E-211ENST00000368166 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.97■■■■□ 3.03
CD1E-211ENST00000368166 SMARCA2P51531 1590 aa33.85■■■■□ 3.01
CD1E-211ENST00000368166 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.84■■■■□ 3.01
CD1E-211ENST00000368166 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.81■■■■□ 3
CD1E-211ENST00000368166 NCAPD3P42695 1498 aa33.79■■■■□ 3
CD1E-211ENST00000368166 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
CD1E-211ENST00000368166 HMGXB3Q12766 1538 aa33.64■■■□□ 2.98
CD1E-211ENST00000368166 WIZO95785 1651 aa33.61■■■□□ 2.97
CD1E-211ENST00000368166 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
CD1E-211ENST00000368166 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
CD1E-211ENST00000368166 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
CD1E-211ENST00000368166 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.93■■■□□ 2.86
CD1E-211ENST00000368166 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.82■■■□□ 2.84
CD1E-211ENST00000368166 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.82■■■□□ 2.84
CD1E-211ENST00000368166 NESP48681 1621 aa32.75■■■□□ 2.83
CD1E-211ENST00000368166 CFTRP13569 1480 aa32.71■■■□□ 2.83
CD1E-211ENST00000368166 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.6■■■□□ 2.81
CD1E-211ENST00000368166 ERCC6Q03468 1493 aa32.51■■■□□ 2.79
CD1E-211ENST00000368166 PRDM2Q13029 1718 aa32.47■■■□□ 2.79
CD1E-211ENST00000368166 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.42■■■□□ 2.78
CD1E-211ENST00000368166 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.38■■■□□ 2.77
CD1E-211ENST00000368166 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.35■■■□□ 2.77
CD1E-211ENST00000368166 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.2■■■□□ 2.75
CD1E-211ENST00000368166 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CD1E-211ENST00000368166 WDR62O43379 1518 aa32.08■■■□□ 2.73
CD1E-211ENST00000368166 ABCC8Q09428 1581 aa32.05■■■□□ 2.72
CD1E-211ENST00000368166 CUX2O14529 1486 aa32.04■■■□□ 2.72
CD1E-211ENST00000368166 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
CD1E-211ENST00000368166 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.95■■■□□ 2.71
CD1E-211ENST00000368166 TOPBP1Q92547 1522 aa31.95■■■□□ 2.7
CD1E-211ENST00000368166 CUX1P39880 1505 aa31.85■■■□□ 2.69
CD1E-211ENST00000368166 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.84■■■□□ 2.69
CD1E-211ENST00000368166 TOP2BQ02880 1626 aa31.71■■■□□ 2.67
CD1E-211ENST00000368166 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.71■■■□□ 2.67
CD1E-211ENST00000368166 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
CD1E-211ENST00000368166 SYNJ1O43426 1573 aa31.68■■■□□ 2.66
CD1E-211ENST00000368166 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.68■■■□□ 2.66
CD1E-211ENST00000368166 IFT140Q96RY7 1462 aa31.66■■■□□ 2.66
CD1E-211ENST00000368166 SOGA1O94964 1423 aa31.6■■■□□ 2.65
CD1E-211ENST00000368166 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CD1E-211ENST00000368166 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.52■■■□□ 2.64
CD1E-211ENST00000368166 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.43■■■□□ 2.62
CD1E-211ENST00000368166 TRIM41Q8WV44 630 aa31.42■■■□□ 2.62
CD1E-211ENST00000368166 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CD1E-211ENST00000368166 WDR97A6NE52 1622 aa31.4■■■□□ 2.62
CD1E-211ENST00000368166 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CD1E-211ENST00000368166 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CD1E-211ENST00000368166 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.32■■■□□ 2.6
CD1E-211ENST00000368166 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.29■■■□□ 2.6
CD1E-211ENST00000368166 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.24■■■□□ 2.59
CD1E-211ENST00000368166 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.23■■■□□ 2.59
CD1E-211ENST00000368166 GRIN2BQ13224 1484 aa31.18■■■□□ 2.58
CD1E-211ENST00000368166 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.17■■■□□ 2.58
CD1E-211ENST00000368166 KIF27Q86VH2 1401 aa31.16■■■□□ 2.58
CD1E-211ENST00000368166 PBRM1Q86U86 1689 aa31.1■■■□□ 2.57
CD1E-211ENST00000368166 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.07■■■□□ 2.56
CD1E-211ENST00000368166 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CD1E-211ENST00000368166 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.04■■■□□ 2.56
CD1E-211ENST00000368166 IGF1RP08069 1367 aa30.97■■■□□ 2.55
CD1E-211ENST00000368166 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.93■■■□□ 2.54
CD1E-211ENST00000368166 SYNJ2O15056 1496 aa30.93■■■□□ 2.54
CD1E-211ENST00000368166 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.9■■■□□ 2.54
CD1E-211ENST00000368166 EEA1Q15075 1411 aa30.9■■■□□ 2.54
CD1E-211ENST00000368166 ADAMTS12P58397 1594 aa30.89■■■□□ 2.54
CD1E-211ENST00000368166 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CD1E-211ENST00000368166 FBLN2P98095 1184 aa30.87■■■□□ 2.53
CD1E-211ENST00000368166 CUL7Q14999 1698 aa30.87■■■□□ 2.53
CD1E-211ENST00000368166 CHD1O14646 1710 aa30.83■■■□□ 2.53
CD1E-211ENST00000368166 OSCARQ8IYS5 282 aa30.81■■■□□ 2.52
CD1E-211ENST00000368166 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.79■■■□□ 2.52
CD1E-211ENST00000368166 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.77■■■□□ 2.52
CD1E-211ENST00000368166 GRIN2AQ12879 1464 aa30.76■■■□□ 2.52
CD1E-211ENST00000368166 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CD1E-211ENST00000368166 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.67■■■□□ 2.5
CD1E-211ENST00000368166 PRXQ9BXM0 1461 aa30.66■■■□□ 2.5
CD1E-211ENST00000368166 NUP160Q12769 1436 aa30.62■■■□□ 2.49
CD1E-211ENST00000368166 CEP170Q5SW79 1584 aa30.56■■■□□ 2.48
CD1E-211ENST00000368166 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.53■■■□□ 2.48
CD1E-211ENST00000368166 KIF21BO75037 1637 aa30.48■■■□□ 2.47
CD1E-211ENST00000368166 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms