Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PLNP26678 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms