Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms