Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms