Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAP1L3Q99457 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms