Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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