Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CXCL9Q07325 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms