Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms