Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PCP4P48539 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms