Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFLP07196 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms