Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAQ29983 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAQ29983 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MICAQ29983 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAQ29983 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAQ29983 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms