Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORCP51449 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORCP51449 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORCP51449 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORCP51449 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms