Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RORCP51449 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RORCP51449 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RORCP51449 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RORCP51449 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RORCP51449 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RORCP51449 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RORCP51449 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RORCP51449 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RORCP51449 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RORCP51449 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RORCP51449 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RORCP51449 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RORCP51449 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RORCP51449 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RORCP51449 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RORCP51449 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RORCP51449 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RORCP51449 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RORCP51449 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RORCP51449 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RORCP51449 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RORCP51449 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RORCP51449 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RORCP51449 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RORCP51449 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RORCP51449 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RORCP51449 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RORCP51449 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RORCP51449 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RORCP51449 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RORCP51449 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RORCP51449 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RORCP51449 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RORCP51449 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RORCP51449 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RORCP51449 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RORCP51449 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RORCP51449 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RORCP51449 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RORCP51449 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RORCP51449 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RORCP51449 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RORCP51449 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RORCP51449 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RORCP51449 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RORCP51449 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RORCP51449 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RORCP51449 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RORCP51449 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RORCP51449 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RORCP51449 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RORCP51449 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RORCP51449 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RORCP51449 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RORCP51449 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RORCP51449 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RORCP51449 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RORCP51449 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RORCP51449 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RORCP51449 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RORCP51449 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RORCP51449 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RORCP51449 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RORCP51449 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RORCP51449 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RORCP51449 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RORCP51449 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RORCP51449 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RORCP51449 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RORCP51449 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RORCP51449 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RORCP51449 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RORCP51449 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RORCP51449 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RORCP51449 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RORCP51449 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RORCP51449 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RORCP51449 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RORCP51449 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RORCP51449 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RORCP51449 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RORCP51449 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RORCP51449 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RORCP51449 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RORCP51449 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RORCP51449 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RORCP51449 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RORCP51449 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RORCP51449 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RORCP51449 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RORCP51449 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RORCP51449 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RORCP51449 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RORCP51449 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RORCP51449 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RORCP51449 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RORCP51449 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RORCP51449 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RORCP51449 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms