Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YIPF1Q9Y548 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YIPF1Q9Y548 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms