Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4BQ9Y4P1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4BQ9Y4P1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4BQ9Y4P1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4BQ9Y4P1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 612.8 ms