Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP15Q9Y4E8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP15Q9Y4E8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP15Q9Y4E8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP15Q9Y4E8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms