Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
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