Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.75■■■■■ 4.91
SPG7Q9UQ90 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
SPG7Q9UQ90 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SPG7Q9UQ90 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
SPG7Q9UQ90 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
SPG7Q9UQ90 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
SPG7Q9UQ90 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
SPG7Q9UQ90 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
SPG7Q9UQ90 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SPG7Q9UQ90 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
SPG7Q9UQ90 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
SPG7Q9UQ90 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SPG7Q9UQ90 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SPG7Q9UQ90 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
SPG7Q9UQ90 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
SPG7Q9UQ90 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SPG7Q9UQ90 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SPG7Q9UQ90 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SPG7Q9UQ90 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SPG7Q9UQ90 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SPG7Q9UQ90 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
SPG7Q9UQ90 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SPG7Q9UQ90 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SPG7Q9UQ90 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SPG7Q9UQ90 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SPG7Q9UQ90 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SPG7Q9UQ90 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SPG7Q9UQ90 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SPG7Q9UQ90 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SPG7Q9UQ90 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SPG7Q9UQ90 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SPG7Q9UQ90 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SPG7Q9UQ90 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SPG7Q9UQ90 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
SPG7Q9UQ90 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SPG7Q9UQ90 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
SPG7Q9UQ90 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
SPG7Q9UQ90 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SPG7Q9UQ90 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SPG7Q9UQ90 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SPG7Q9UQ90 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SPG7Q9UQ90 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SPG7Q9UQ90 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SPG7Q9UQ90 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SPG7Q9UQ90 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SPG7Q9UQ90 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SPG7Q9UQ90 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SPG7Q9UQ90 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SPG7Q9UQ90 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SPG7Q9UQ90 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SPG7Q9UQ90 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
SPG7Q9UQ90 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SPG7Q9UQ90 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
SPG7Q9UQ90 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SPG7Q9UQ90 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SPG7Q9UQ90 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SPG7Q9UQ90 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SPG7Q9UQ90 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SPG7Q9UQ90 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SPG7Q9UQ90 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SPG7Q9UQ90 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SPG7Q9UQ90 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SPG7Q9UQ90 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SPG7Q9UQ90 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SPG7Q9UQ90 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SPG7Q9UQ90 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SPG7Q9UQ90 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SPG7Q9UQ90 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SPG7Q9UQ90 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SPG7Q9UQ90 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
SPG7Q9UQ90 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SPG7Q9UQ90 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SPG7Q9UQ90 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SPG7Q9UQ90 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SPG7Q9UQ90 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SPG7Q9UQ90 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SPG7Q9UQ90 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SPG7Q9UQ90 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SPG7Q9UQ90 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SPG7Q9UQ90 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SPG7Q9UQ90 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SPG7Q9UQ90 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SPG7Q9UQ90 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SPG7Q9UQ90 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SPG7Q9UQ90 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SPG7Q9UQ90 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SPG7Q9UQ90 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
SPG7Q9UQ90 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SPG7Q9UQ90 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SPG7Q9UQ90 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SPG7Q9UQ90 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SPG7Q9UQ90 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SPG7Q9UQ90 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SPG7Q9UQ90 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SPG7Q9UQ90 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SPG7Q9UQ90 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SPG7Q9UQ90 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SPG7Q9UQ90 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
SPG7Q9UQ90 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SPG7Q9UQ90 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
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