Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SRRM2Q9UQ35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms