Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARDHQ9UL12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARDHQ9UL12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms