Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRODH2Q9UF12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRODH2Q9UF12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRODH2Q9UF12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms