Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTRRQ9UBK8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTRRQ9UBK8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRRQ9UBK8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms