Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC51.17■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC51.15■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC51.13■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC51.12■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.1■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC51.09■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC51.09■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC51.09■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
CCDC180Q9P1Z9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC51.06■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC51.06■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC51.04■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC51.02■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
CCDC180Q9P1Z9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC51■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC51■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC51■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.98■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC50.97■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC50.96■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC50.96■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC50.96■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC50.95■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC50.95■■■■■ 5.75
CCDC180Q9P1Z9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.93■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC50.93■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.93■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC50.92■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC50.9■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.88■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC50.88■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
CCDC180Q9P1Z9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC50.85■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC50.83■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC50.83■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC50.82■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
CCDC180Q9P1Z9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC50.81■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC50.81■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC50.8■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
CCDC180Q9P1Z9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC50.77■■■■■ 5.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms