Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD2Q9NZR1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD2Q9NZR1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms