Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TMOD2Q9NZR1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TMOD2Q9NZR1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TMOD2Q9NZR1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TMOD2Q9NZR1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TMOD2Q9NZR1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TMOD2Q9NZR1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TMOD2Q9NZR1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
TMOD2Q9NZR1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TMOD2Q9NZR1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TMOD2Q9NZR1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TMOD2Q9NZR1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TMOD2Q9NZR1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TMOD2Q9NZR1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TMOD2Q9NZR1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TMOD2Q9NZR1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TMOD2Q9NZR1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TMOD2Q9NZR1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TMOD2Q9NZR1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TMOD2Q9NZR1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TMOD2Q9NZR1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TMOD2Q9NZR1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TMOD2Q9NZR1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TMOD2Q9NZR1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TMOD2Q9NZR1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TMOD2Q9NZR1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TMOD2Q9NZR1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TMOD2Q9NZR1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TMOD2Q9NZR1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TMOD2Q9NZR1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TMOD2Q9NZR1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TMOD2Q9NZR1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TMOD2Q9NZR1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TMOD2Q9NZR1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TMOD2Q9NZR1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TMOD2Q9NZR1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TMOD2Q9NZR1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TMOD2Q9NZR1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
TMOD2Q9NZR1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TMOD2Q9NZR1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TMOD2Q9NZR1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TMOD2Q9NZR1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TMOD2Q9NZR1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TMOD2Q9NZR1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TMOD2Q9NZR1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TMOD2Q9NZR1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TMOD2Q9NZR1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TMOD2Q9NZR1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TMOD2Q9NZR1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMOD2Q9NZR1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TMOD2Q9NZR1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TMOD2Q9NZR1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TMOD2Q9NZR1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TMOD2Q9NZR1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TMOD2Q9NZR1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TMOD2Q9NZR1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TMOD2Q9NZR1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMOD2Q9NZR1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TMOD2Q9NZR1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TMOD2Q9NZR1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TMOD2Q9NZR1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMOD2Q9NZR1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMOD2Q9NZR1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMOD2Q9NZR1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMOD2Q9NZR1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMOD2Q9NZR1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TMOD2Q9NZR1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMOD2Q9NZR1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMOD2Q9NZR1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TMOD2Q9NZR1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TMOD2Q9NZR1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TMOD2Q9NZR1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TMOD2Q9NZR1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMOD2Q9NZR1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TMOD2Q9NZR1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMOD2Q9NZR1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMOD2Q9NZR1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TMOD2Q9NZR1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMOD2Q9NZR1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TMOD2Q9NZR1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TMOD2Q9NZR1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TMOD2Q9NZR1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TMOD2Q9NZR1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TMOD2Q9NZR1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TMOD2Q9NZR1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TMOD2Q9NZR1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TMOD2Q9NZR1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TMOD2Q9NZR1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TMOD2Q9NZR1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TMOD2Q9NZR1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TMOD2Q9NZR1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TMOD2Q9NZR1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TMOD2Q9NZR1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TMOD2Q9NZR1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TMOD2Q9NZR1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TMOD2Q9NZR1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TMOD2Q9NZR1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TMOD2Q9NZR1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TMOD2Q9NZR1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TMOD2Q9NZR1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms