Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXD2Q9NVH0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms