Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GKN1Q9NS71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKN1Q9NS71 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms