Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC31BQ9NQW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC31BQ9NQW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms