Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms