Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TUFT1Q9NNX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUFT1Q9NNX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFT1Q9NNX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms