Protein–RNA interactions for Protein: Q9H511

KLHL31, Kelch-like protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL31Q9H511 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL31Q9H511 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL31Q9H511 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL31Q9H511 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL31Q9H511 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL31Q9H511 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL31Q9H511 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL31Q9H511 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms