Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN2Q9H000 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN2Q9H000 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 447.3 ms