Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAPERQ9BY12 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAPERQ9BY12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SCAPERQ9BY12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SCAPERQ9BY12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms