Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNPPD1Q9BV87 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPPD1Q9BV87 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms