Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4K2AQ9BTU6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4K2AQ9BTU6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PI4K2AQ9BTU6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms