Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms