Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPATA25Q9BR10 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPATA25Q9BR10 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPATA25Q9BR10 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPATA25Q9BR10 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPATA25Q9BR10 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPATA25Q9BR10 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPATA25Q9BR10 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms