Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN3Q9BQT9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN3Q9BQT9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms