Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLSTN3Q9BQT9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLSTN3Q9BQT9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLSTN3Q9BQT9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLSTN3Q9BQT9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLSTN3Q9BQT9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLSTN3Q9BQT9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLSTN3Q9BQT9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CLSTN3Q9BQT9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLSTN3Q9BQT9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLSTN3Q9BQT9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLSTN3Q9BQT9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLSTN3Q9BQT9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLSTN3Q9BQT9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLSTN3Q9BQT9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CLSTN3Q9BQT9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLSTN3Q9BQT9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLSTN3Q9BQT9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLSTN3Q9BQT9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CLSTN3Q9BQT9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLSTN3Q9BQT9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLSTN3Q9BQT9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CLSTN3Q9BQT9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSTN3Q9BQT9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSTN3Q9BQT9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLSTN3Q9BQT9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLSTN3Q9BQT9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLSTN3Q9BQT9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLSTN3Q9BQT9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLSTN3Q9BQT9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLSTN3Q9BQT9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLSTN3Q9BQT9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLSTN3Q9BQT9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSTN3Q9BQT9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CLSTN3Q9BQT9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSTN3Q9BQT9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLSTN3Q9BQT9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLSTN3Q9BQT9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CLSTN3Q9BQT9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSTN3Q9BQT9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSTN3Q9BQT9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLSTN3Q9BQT9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLSTN3Q9BQT9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLSTN3Q9BQT9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLSTN3Q9BQT9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLSTN3Q9BQT9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLSTN3Q9BQT9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLSTN3Q9BQT9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSTN3Q9BQT9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLSTN3Q9BQT9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLSTN3Q9BQT9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLSTN3Q9BQT9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLSTN3Q9BQT9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLSTN3Q9BQT9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLSTN3Q9BQT9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CLSTN3Q9BQT9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CLSTN3Q9BQT9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CLSTN3Q9BQT9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLSTN3Q9BQT9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLSTN3Q9BQT9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLSTN3Q9BQT9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLSTN3Q9BQT9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLSTN3Q9BQT9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLSTN3Q9BQT9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLSTN3Q9BQT9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLSTN3Q9BQT9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLSTN3Q9BQT9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLSTN3Q9BQT9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLSTN3Q9BQT9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLSTN3Q9BQT9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLSTN3Q9BQT9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLSTN3Q9BQT9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLSTN3Q9BQT9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLSTN3Q9BQT9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLSTN3Q9BQT9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLSTN3Q9BQT9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLSTN3Q9BQT9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLSTN3Q9BQT9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLSTN3Q9BQT9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLSTN3Q9BQT9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLSTN3Q9BQT9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLSTN3Q9BQT9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLSTN3Q9BQT9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLSTN3Q9BQT9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CLSTN3Q9BQT9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLSTN3Q9BQT9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLSTN3Q9BQT9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLSTN3Q9BQT9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLSTN3Q9BQT9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CLSTN3Q9BQT9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLSTN3Q9BQT9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLSTN3Q9BQT9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLSTN3Q9BQT9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLSTN3Q9BQT9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLSTN3Q9BQT9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLSTN3Q9BQT9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CLSTN3Q9BQT9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms