Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELF4Q99607 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF4Q99607 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELF4Q99607 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF4Q99607 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms