Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KC1Q96S38 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms