Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP3Q96P47 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP3Q96P47 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP3Q96P47 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms