Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC7Q96M83 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC7Q96M83 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCDC7Q96M83 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC7Q96M83 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms