Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC7Q96M83 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CCDC7Q96M83 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
CCDC7Q96M83 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
CCDC7Q96M83 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC7Q96M83 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
CCDC7Q96M83 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
CCDC7Q96M83 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
CCDC7Q96M83 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CCDC7Q96M83 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC7Q96M83 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC7Q96M83 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
CCDC7Q96M83 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CCDC7Q96M83 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CCDC7Q96M83 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CCDC7Q96M83 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CCDC7Q96M83 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC7Q96M83 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CCDC7Q96M83 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CCDC7Q96M83 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC7Q96M83 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC7Q96M83 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CCDC7Q96M83 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC7Q96M83 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC7Q96M83 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CCDC7Q96M83 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CCDC7Q96M83 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC7Q96M83 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
CCDC7Q96M83 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CCDC7Q96M83 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC7Q96M83 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC7Q96M83 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CCDC7Q96M83 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CCDC7Q96M83 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC7Q96M83 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CCDC7Q96M83 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CCDC7Q96M83 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC7Q96M83 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC7Q96M83 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC7Q96M83 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC7Q96M83 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC7Q96M83 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC7Q96M83 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC7Q96M83 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC7Q96M83 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC7Q96M83 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CCDC7Q96M83 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC7Q96M83 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC7Q96M83 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC7Q96M83 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC7Q96M83 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC7Q96M83 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC7Q96M83 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CCDC7Q96M83 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCDC7Q96M83 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCDC7Q96M83 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CCDC7Q96M83 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCDC7Q96M83 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
CCDC7Q96M83 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
CCDC7Q96M83 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCDC7Q96M83 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCDC7Q96M83 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CCDC7Q96M83 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC7Q96M83 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC7Q96M83 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC7Q96M83 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC7Q96M83 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC7Q96M83 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC7Q96M83 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC7Q96M83 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC7Q96M83 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CCDC7Q96M83 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC7Q96M83 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC7Q96M83 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC7Q96M83 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC7Q96M83 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC7Q96M83 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC7Q96M83 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC7Q96M83 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC7Q96M83 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC7Q96M83 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC7Q96M83 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC7Q96M83 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC7Q96M83 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC7Q96M83 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC7Q96M83 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC7Q96M83 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC7Q96M83 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC7Q96M83 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC7Q96M83 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC7Q96M83 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC7Q96M83 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC7Q96M83 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC7Q96M83 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC7Q96M83 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC7Q96M83 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC7Q96M83 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC7Q96M83 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC7Q96M83 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC7Q96M83 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms