Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC17Q96LX7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC17Q96LX7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms