Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR1Q96JP9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDHR1Q96JP9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDHR1Q96JP9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms