Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.365e-7■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.053e-11■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.073e-11■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.113e-11■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.133e-11■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.253e-11■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.263e-11■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 OPA1-217ENST00000495261 3660 ntTSL 1 (best)2.06□□□□□ -2.083e-11■■■■□ 24.2
FUBP3Q96I24 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.1
FUBP3Q96I24 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 24.1
FUBP3Q96I24 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.062e-17■■■■□ 24.1
FUBP3Q96I24 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-8■■■■□ 24
FUBP3Q96I24 SEC24D-206ENST00000505134 3915 ntTSL 24.7□□□□□ -1.661e-8■■■■□ 24
FUBP3Q96I24 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.833e-7■■■■□ 24
FUBP3Q96I24 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.243e-7■■■■□ 24
FUBP3Q96I24 SON-212ENST00000470533 798 ntTSL 55.64□□□□□ -1.517e-15■■■■□ 23.9
FUBP3Q96I24 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.536e-7■■■■□ 23.9
FUBP3Q96I24 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 23.9
FUBP3Q96I24 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.51e-6■■■■□ 23.9
FUBP3Q96I24 SLC4A7-202ENST00000419036 6447 ntTSL 1 (best)4.23□□□□□ -1.731e-6■■■■□ 23.9
FUBP3Q96I24 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.931e-6■■■■□ 23.9
FUBP3Q96I24 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.158e-7■■■■□ 23.8
FUBP3Q96I24 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.594e-7■■■■□ 23.8
FUBP3Q96I24 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.412e-6■■■■□ 23.7
FUBP3Q96I24 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.235e-6■■■■□ 23.7
FUBP3Q96I24 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-8■■■■□ 23.7
FUBP3Q96I24 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 23.6
FUBP3Q96I24 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.441e-7■■■■□ 23.6
FUBP3Q96I24 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.771e-7■■■■□ 23.6
FUBP3Q96I24 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.296e-9■■■■□ 23.6
FUBP3Q96I24 TM2D3-209ENST00000560013 1868 ntTSL 224.53■■□□□ 1.521e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 TM2D3-208ENST00000559891 2133 ntTSL 1 (best)12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 TM2D3-215ENST00000561373 1734 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 TM2D3-203ENST00000428002 1267 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 TM2D3-204ENST00000558129 864 ntTSL 310.44□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-214ENST00000618160 3252 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.347e-8■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.223e-11■■■■□ 23.5
FUBP3Q96I24 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.026e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.596e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.576e-11■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.276e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.086e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.826e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.626e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.596e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.526e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.356e-11■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.356e-11■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.216e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 TCEA1-207ENST00000521086 2966 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.176e-11■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.266e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SLC30A9-205ENST00000513699 2217 ntTSL 213.12□□□□□ -0.316e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.336e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.346e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.386e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.396e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 FAM46A-204ENST00000412306 546 ntTSL 311.76□□□□□ -0.536e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 MERTK-203ENST00000421804 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.596e-11■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.596e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 MERTK-201ENST00000295408 3954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.656e-11■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 PHLPP2-203ENST00000564884 2077 ntTSL 210.4□□□□□ -0.746e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 PAQR9-202ENST00000492509 1824 ntTSL 29.91□□□□□ -0.826e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.856e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.866e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 MERTK-202ENST00000409780 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.886e-11■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 HAT1-206ENST00000494601 3845 ntTSL 1 (best)9.46□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.926e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.996e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 PHLPP2-205ENST00000568004 3099 ntTSL 1 (best)8.86□□□□□ -0.996e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 AC013394.1-202ENST00000630790 4499 ntTSL 28.76□□□□□ -1.016e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.016e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.026e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 HAT1-203ENST00000412731 1567 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.061e-7■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.116e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.116e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SMC2-205ENST00000493955 1408 ntTSL 1 (best)8.13□□□□□ -1.116e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 FOXP1-203ENST00000327590 5685 ntTSL 27.64□□□□□ -1.196e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 HMGXB4-202ENST00000418170 4216 ntTSL 1 (best)7.61□□□□□ -1.196e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.236e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 27.21□□□□□ -1.256e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.296e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.316e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.326e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 CHD6-209ENST00000482596 599 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.326e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SLC30A9-203ENST00000509683 1078 ntTSL 36.56□□□□□ -1.366e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.48□□□□□ -1.376e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 DR1-203ENST00000481583 1244 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.386e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.396e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.396e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.396e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 CHD6-204ENST00000440647 536 ntTSL 36.25□□□□□ -1.416e-6■■■■□ 23.4
FUBP3Q96I24 SUPT3H-204ENST00000459689 396 ntTSL 26.13□□□□□ -1.436e-6■■■■□ 23.4
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 309.7 ms