RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342228.7

SLC20A2-201, Transcript of solute carrier family 20 member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A2, Length 3,657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A2-201ENST00000342228 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC20A2-201ENST00000342228 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.78■■□□□ 1.24
SLC20A2-201ENST00000342228 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC20A2-201ENST00000342228 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SLC20A2-201ENST00000342228 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SLC20A2-201ENST00000342228 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC20A2-201ENST00000342228 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC20A2-201ENST00000342228 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC20A2-201ENST00000342228 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC20A2-201ENST00000342228 HRCP23327 699 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC20A2-201ENST00000342228 ABCC9O60706 1549 aa21.34■■□□□ 1.01
SLC20A2-201ENST00000342228 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.31■■□□□ 1
SLC20A2-201ENST00000342228 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.24■□□□□ 0.99
SLC20A2-201ENST00000342228 SCRIBQ14160 1630 aa21.2■□□□□ 0.98
SLC20A2-201ENST00000342228 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
SLC20A2-201ENST00000342228 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SLC20A2-201ENST00000342228 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.97■□□□□ 0.95
SLC20A2-201ENST00000342228 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SLC20A2-201ENST00000342228 NACADO15069 1562 aa20.82■□□□□ 0.92
SLC20A2-201ENST00000342228 TRIM41Q8WV44 630 aa20.82■□□□□ 0.92
SLC20A2-201ENST00000342228 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.79■□□□□ 0.92
SLC20A2-201ENST00000342228 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.74■□□□□ 0.91
SLC20A2-201ENST00000342228 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC20A2-201ENST00000342228 WIZO95785 1651 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC20A2-201ENST00000342228 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SLC20A2-201ENST00000342228 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC20A2-201ENST00000342228 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC20A2-201ENST00000342228 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SLC20A2-201ENST00000342228 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SLC20A2-201ENST00000342228 SMARCA4P51532 1647 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC20A2-201ENST00000342228 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC20A2-201ENST00000342228 ABCC8Q09428 1581 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC20A2-201ENST00000342228 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC20A2-201ENST00000342228 SMARCA2P51531 1590 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC20A2-201ENST00000342228 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC20A2-201ENST00000342228 SOGA1O94964 1423 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC20A2-201ENST00000342228 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
SLC20A2-201ENST00000342228 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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SLC20A2-201ENST00000342228 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SLC20A2-201ENST00000342228 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.98■□□□□ 0.79
SLC20A2-201ENST00000342228 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.97■□□□□ 0.79
SLC20A2-201ENST00000342228 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.95■□□□□ 0.78
SLC20A2-201ENST00000342228 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SLC20A2-201ENST00000342228 EEA1Q15075 1411 aa19.91■□□□□ 0.78
SLC20A2-201ENST00000342228 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.89■□□□□ 0.78
SLC20A2-201ENST00000342228 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
SLC20A2-201ENST00000342228 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.88■□□□□ 0.77
SLC20A2-201ENST00000342228 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SLC20A2-201ENST00000342228 GOLGA3Q08378 1498 aa19.81■□□□□ 0.76
SLC20A2-201ENST00000342228 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SLC20A2-201ENST00000342228 SYNJ1O43426 1573 aa19.78■□□□□ 0.76
SLC20A2-201ENST00000342228 KIF21BO75037 1637 aa19.7■□□□□ 0.74
SLC20A2-201ENST00000342228 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.69■□□□□ 0.74
SLC20A2-201ENST00000342228 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.68■□□□□ 0.74
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SLC20A2-201ENST00000342228 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SLC20A2-201ENST00000342228 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SLC20A2-201ENST00000342228 NEUROD1Q13562 356 aa19.59■□□□□ 0.73
SLC20A2-201ENST00000342228 CLIP1P30622 1438 aa19.58■□□□□ 0.73
SLC20A2-201ENST00000342228 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.56■□□□□ 0.72
SLC20A2-201ENST00000342228 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.53■□□□□ 0.72
SLC20A2-201ENST00000342228 TOP2BQ02880 1626 aa19.51■□□□□ 0.71
SLC20A2-201ENST00000342228 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SLC20A2-201ENST00000342228 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SLC20A2-201ENST00000342228 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.45■□□□□ 0.7
SLC20A2-201ENST00000342228 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa19.39■□□□□ 0.7
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SLC20A2-201ENST00000342228 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
SLC20A2-201ENST00000342228 PRXQ9BXM0 1461 aa19.35■□□□□ 0.69
SLC20A2-201ENST00000342228 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.34■□□□□ 0.69
SLC20A2-201ENST00000342228 APLP2Q06481 763 aa19.33■□□□□ 0.68
SLC20A2-201ENST00000342228 ARAP1Q96P48 1450 aa19.31■□□□□ 0.68
SLC20A2-201ENST00000342228 CUX1P39880 1505 aa19.3■□□□□ 0.68
SLC20A2-201ENST00000342228 HMGXB3Q12766 1538 aa19.29■□□□□ 0.68
SLC20A2-201ENST00000342228 NCAPD3P42695 1498 aa19.27■□□□□ 0.68
SLC20A2-201ENST00000342228 MIER1Q8N108 512 aa19.24■□□□□ 0.67
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SLC20A2-201ENST00000342228 KIF27Q86VH2 1401 aa19.17■□□□□ 0.66
SLC20A2-201ENST00000342228 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
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SLC20A2-201ENST00000342228 PRDM2Q13029 1718 aa19.07■□□□□ 0.64
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SLC20A2-201ENST00000342228 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.99■□□□□ 0.63
SLC20A2-201ENST00000342228 IGF1RP08069 1367 aa18.99■□□□□ 0.63
SLC20A2-201ENST00000342228 TIAM1Q13009 1591 aa18.92■□□□□ 0.62
SLC20A2-201ENST00000342228 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.9■□□□□ 0.62
SLC20A2-201ENST00000342228 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.9■□□□□ 0.62
SLC20A2-201ENST00000342228 MAP3K1Q13233 1512 aa18.9■□□□□ 0.62
SLC20A2-201ENST00000342228 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.88■□□□□ 0.61
SLC20A2-201ENST00000342228 ITGAEP38570 1179 aa18.88■□□□□ 0.61
SLC20A2-201ENST00000342228 MAPKBP1O60336 1514 aa18.86■□□□□ 0.61
SLC20A2-201ENST00000342228 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.86■□□□□ 0.61
SLC20A2-201ENST00000342228 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.84■□□□□ 0.61
SLC20A2-201ENST00000342228 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.81■□□□□ 0.6
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